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接下来探讨密教所谓的本尊瑜伽。本尊瑜伽的修法如同心月轮一样，它是心月轮的一部分，只是加上以某一尊佛菩萨为本尊的观想，比月轮观稍微复杂而已，如“毘卢遮那佛”与秘密主对话：
尔时执金刚秘密主白佛言：“世尊！愿说诸尊色像威验现前，令真言门修菩萨行诸菩萨观缘本尊形故，即本尊身以为自身，无有疑惑而得悉地。”如是说已，佛告执金刚秘密主言：“善哉！善哉！秘密主！汝能问吾如是义，善哉！谛听极善作意，吾今演说。”[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说本尊三昧品第28〉，《大正藏》册18，页44，上10-15。]
又譬如“毘卢遮那佛”与秘密主另一处对话如下：
若依法教，于真言门修菩萨行诸菩萨应如是知：自身住本尊形，坚固不动；知本尊已，如本尊住，而得悉地。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷5〈秘密八印品第14〉，《大正藏》册18，页37，上2-4。]
由“毘卢遮那佛”与秘密主对话可知，《大日经》已谈到本尊瑜伽，也就是要观想某一尊佛菩萨本尊出现、观想佛菩萨本尊入行者身，行者观想自己也进入佛菩萨本尊身中而安住，也就是密教行者所说的入我、我入，而且还要坚固地认为自己就是佛菩萨本尊，《大日经》的“毘卢遮那佛”宣称这样可以成就所说的种种悉地，乃至成佛。由此缘故，有二人如是描述本尊瑜伽的真实内涵，如第一位学者描述：
密宗本尊法，又名本尊瑜伽，为密宗的重要大法，体现了密宗变身的原理，随著越来越多的佛菩萨登上密坛，涉及的范围甚为广泛，为密宗行者生起次第所必修。
本尊法，即是密宗行者在诸佛菩萨中，选定一位与你有缘的佛尊作为本体佛，观想自身变成本体佛的修法。《大日经》云：一身与二身，乃至无量身，同入本体。本尊法的修持，即根据此原理。用通俗的话说，即是：你就是本尊，本尊就是你。例如，你若修阿弥陀佛为本尊，你就观想自己为阿弥陀佛；你若修观世音菩萨为本尊，你就观想自己为观世音菩萨，等等。密宗行者可始终如一专修一尊本尊，这是一心与本尊融合，才能变成本尊的缘故。这种变身的原理，主要在于密宗行者的身、口、意三密，成为本尊的身、口、意三密，密宗行者完全与本尊相应。《密教通关》一书说：诸佛三密与行者三密，共遍法界，平等平等，故诸佛真言印契，与行者真言印契，亦平等无二。以印明皆等，故能引诸佛入吾身也，诸佛既入我身，故其功德亦为我有。[邱陵编著，《密宗入门知识》，北京工业大学出版社（北京市），1993.1初版1刷，页70。]
另一位密教行者描述本尊瑜伽内涵如下：
故密宗行者之所观本尊，多为佛和菩萨。诸佛菩萨传了诸多法门，有诸多心咒，你修哪位佛菩萨，观其形神，诵其密咒，发其心愿，哪位佛菩萨便是你的本尊。修本尊法时，行者便有了一个灵魂标杆，除将凡俗色身观为智慧佛身外，其身口意，不离慈悲，不离真言，所闻无非咒声，所见无非本尊坛城，所做皆是利众之事，久久熏习，人格定然升华，终而与本尊无二无别。[雪漠著，《光明大手印：实修心髓》上卷，中央编译出版社（北京市），2012.4初版2刷，页172-173。]
所谓密教的本尊瑜伽，就是密教行者选定一位佛菩萨，这位佛菩萨本身具备了字、印、形像[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说本尊三昧品第28〉：“佛言：‘秘密主！诸尊有三种身，所谓字、印、形像。’”《大正藏》册18，页44，上16-17，其中字为种子字，印为佛菩萨手印、所持的器物等，形像为本尊的法相。]，作为密教行者所观想的对象，然后将其观想清楚后，本尊的佛菩萨（编案：其实是行者自己观想所现的内相分）就会出现在行者前，这时行者要“入我、我入”及明显地、坚决地生起“佛慢”，这时候“你就是本尊、你就是佛”[尕藏加著，《密宗—藏传佛教神秘文化》，中国藏学出版社（北京市），2007.1初版1刷，页132-133。]—自己与本尊、自己与佛菩萨无二无别；所以密教行者非常注重本尊瑜伽的修练，认为可以使自己快速成佛，这也是学者所说，本尊瑜伽观想修定法门，乃是假藏传佛教重要特色之一之所在。
由于各派所说的本尊瑜伽方法各不相同，乃至同一派各个上师所说的内容也不尽相同，但不外四个大方向：一、观想本尊或本尊与佛母双运，显现在行者对面的空中，并化作一道光芒，罩住行者，使行者心安住不动。二、观想本尊或本尊与佛母双运移到行者头上，放出光芒，流出甘露水（男女交合所产生男精女血的淫液），充满行者自身，消除行者一切业障而得大自在。三、观想本尊或本尊与佛母双运缩小，成为一个小光点（编案：这也是密教行者修心月轮的收敛观之所在），从行者顶门，直入行者月轮莲花座上。四、观想光点之本尊或本尊与佛母双运变大，与自身一样大，完全与本尊或本尊与佛母双运合一，行者一切的成就，与本尊成就无二无别。其详细步骤说明如下：
第一步骤：选本尊。由于藏密各派所观的本尊各不相同，譬如有人用莲花生为本尊，有人用大威德金刚为本尊，有人用密集金刚为本尊，乃至有人用佛菩萨与佛母双运为本尊等等，为避免产生困扰，统一用本尊一词来说明。密教选本尊的方法有下列四种方法：第一种方法，散花得佛；第二种方法，干支得佛；第三种方法，根据行者自己意愿和心性选择本尊；第四种方法，上师根据徒弟的特性、习性、素质和了解，为徒弟选择本尊。如一位学者所说：
密宗行者选择自己本尊的方法有多种，首先有散花得佛之法，即利用散花来寻找本体佛。行者面向曼荼罗（即坛城，罗列诸佛菩萨像的密坛），两眼紧闭，或用布巾包住眼睛，然后手拿花朵，心中虔诚念祷，把花朵抛向曼荼罗，花朵落在哪一位佛尊之上，就表示哪位佛尊与你有缘，可以成为你的本尊。
使用散花得佛的方法，必须先有曼荼罗，如果没有曼荼罗的设备，密宗于是用干支得佛之法。散花得佛选出的本尊，是后天的本体佛，干支得佛是与生俱来的先天的本体佛。干支得佛之法，就是依照行者的生年干支，去决定自身的本尊。
各生年的干支本尊如下：鼠年：千手观音菩萨，牛年：虚空藏菩萨，虎年：虚空藏菩萨，兔年：文殊菩萨，龙年：普贤菩萨，蛇年：普贤菩萨，马年：大势至菩萨，羊年：大日如来，猴年：大日如来，鸡年：不动明王，狗年：阿弥陀佛，猪年：阿弥陀佛。
除了生年的本尊外，也有出生月份的本尊，前者为主，后者为副。农历出生月份的本尊如下：元月：虚空藏菩萨，二月：文殊菩萨，三月：普贤菩萨，四月：普贤菩萨，五月：大势至菩萨，六月：大日如来，七月：大日如来，八月：不动明王，九月：阿弥陀佛，十月：阿弥陀佛，十一月：千手观音菩萨，十二月：虚空藏菩萨。
除上述方法外，也有利用缘日来选本尊的。缘日就是有缘之日，即是看你在农历哪一天出生，就代表该缘日的佛菩萨与你有缘，会终生伴著你。
缘日和缘日本尊对照如下：一日：定光佛，二日：燃灯佛，三日：多宝佛，四日：阿閦佛，五日：弥勒菩萨，六日：二万灯佛，七日：三万灯佛，八日：药师如来，九日：大通智胜佛，十日：日月灯明佛，十一日：欢喜佛，十二日：难胜如来，十三日：虚空藏菩萨，十四日：普贤菩萨，十五日：阿弥陀佛，十六日：陀罗尼菩萨，十七日：龙树菩萨，十八日：观世音菩萨，十九日：日光菩萨，二十日：月光菩萨，二十一日：无尽意菩萨，二十二日：施无畏菩萨，二十三日：大势至菩萨，二十四日：地藏菩萨，二十五日：文殊师利菩萨，二十六日：药王菩萨，二十七日：毗庐遮那如来，二十八日：大日如来，二十九日：药王菩萨，三十日：释迦如来。
除了上述方法，密宗行者也可以根据自己的意愿和心性选择本尊。行者认为哪一尊佛菩萨与自己最投缘，最有缘份，就自行选择为自己的本尊。这样也许更有意义。
当然也可由上师根据徒弟的特性、习性、素质和了解，为徒弟选择本尊。有的红教法派规定男弟子一律以莲华生大士为本尊，女弟子一律以绿度母为本尊，这也未尝不可。[邱陵编著，《密宗入门知识》，北京工业大学出版社（北京市），1993.1初版1刷，页71-74。]
第二步骤：修练本尊的方法，有对生本尊、自生本尊、顶生本尊、肩生本尊。所谓的对生本尊，就是于行者四尺前挂本尊佛菩萨图像，以作为行者观想之用。所谓的自生本尊，是心中直观本尊佛菩萨相。所谓的顶生本尊，是修百字明[百字明，乃是密教行者所创造的咒语，根本不是佛菩萨所说的咒语，其本质与男女双运邪淫法有关，其所忏悔的对象是鬼神，而不是佛菩萨，故密教行者欲忏悔灭罪而唱诵的百字明，其忏悔根本无效，欲知详情，请参阅平实导师著，《狂密与真密》第四辑，正智出版社（台北市），2002.8初版1刷，页1195-1198。除此之外，密教行者还创造百字明手印如下：“两手内内相叉，二大指〔空轮〕、食指〔风轮〕、并伸直。”慧律法师讲授，释法印整理，《安乐妙宝仪轨》（一），倡印者：财团法人文殊文教基金会，流通者：高雄文殊讲堂，2004.5新版1刷，页72。]或迁识瑜伽（于第三章第七节介绍）等法时，观想在自己顶上约一箭的高度，有一尺高的本尊佛菩萨相，与自己同一方向。所谓的肩生本尊，就是行走时，观想本尊佛菩萨立于右肩。一般而言，选对生本尊、自生本尊及顶生本尊比较多，因此本节仅介绍这三种。刚开始修练的时候，对于本尊瑜伽观想无法掌握重点，可先练习对生本尊的图像观想，于此练习纯熟了，直接进行自生本尊的观法。（编案：这是根据密教法作说明，非是鼓励读者修学。）但不论是对生本尊或自生本尊，都是缘同一个本尊进行观想，如善无畏在《大日经》卷7说明：
行者应生决定意，先当一缘观本尊，持彼真言秘密印，自作瑜伽本尊像，如其色相威仪等，我身无二行亦同，由住本地相应身，虽少福者亦成就。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷7〈持诵法则品第4〉，《大正藏》册18，页51，中14-17。]
第三步骤：进行三密修行，即念本尊咒语、结本尊印及观想本尊。观想本尊有六个小步骤如下：
第一点：观想本尊现身在行者正对面空中，发出一道光笼罩行者而安住不动。
第二点：观想本尊移到行者头上放光明（编案：即顶生本尊），以及本尊流出甘露水灌行者顶，甘露水遍满行者全身而消除一切业障，身中黑气从全身毛孔排出（编案：这是密教行者观想所成的内相分，也是密教行者的的虚妄想，妄想业障化成黑气从全身毛孔排出）。
第三点：观想头顶上的本尊缩小成一个小点，从行者顶上直入月轮莲花座上，此时本尊化成一拇指大，就在行者心中的莲花座上。至于观想本尊缩小成一个小点，是无上瑜伽密教行者心月轮之收敛观、红菩提从脐轮出现、红白菩提在顶轮融合为一，乃至与那洛六法有关的前方便。
第四点：观想本尊渐渐变大，与行者身体一样大，并与自己身体合一，而且还要清清楚楚、明明白白，如《大日经》卷7善无畏所说：
住于本尊位，正觉当现前，乃至谛明了，应当如是见。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷7〈持诵法则品第4〉，《大正藏》册18，页51，下28-29。]
第五点：入我、我入，起“佛慢”。行者于此清清楚楚、明明白白的状态中，要进行“入我、我入”，起“佛慢”，即本尊入我身（入我）、我入本尊（我入），这时，不再起自己是凡夫众生的下劣想，自身已变成佛菩萨本尊，自己也继承佛菩萨本尊的种种功德，如《大日经》卷6的“毘卢遮那佛”所说：
是故诸本尊即我，我即本尊，互相发起，身所生身，尊形像生。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈百字位成品第21〉，《大正藏》册18，页41，上13-14。]
不仅如此，善无畏也主张“观想本尊瑜伽成就后，自己就是佛了”：
如前住瑜伽，加持亦如是，智者观自体，等同如来身。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷7〈持诵法则品第4〉，《大正藏》册18，页52，下8-10。]
像这样不再起凡夫众生下劣想，而且明显地、坚决地认为自己就是佛，而以佛自居，就是密教行者所说的“佛慢”，而且是“佛慢坚固”，正如一位密教行者所说：
生起次第最主要的目的就是，首先破除“我是凡夫”这种观念。这个见地非常重要。无上瑜伽的真正精髓正是这一点，它直接告诉你：你是佛，不是凡夫；你是本尊，本尊就是你。[雪漠著，《光明大手印：实修心髓》下卷，中央编译出版社（北京市），2012.4初版2刷，页78。]
第六点：缘有相、无相、有想、无想，以此来分清净与否之差别。行者进行“入我、我入”、起“佛慢”以后，以一念不生而了了常知的状态安住，这时，缘本尊有形有相故，是有想、有分别，表示行者的心不清净；如果行者观察这个能观察本尊的意识心无形无相，是无想、无分别（编案：其实仍然有分别，妄谓没有分别），表示行者的心是清净的，如《大日经》卷6的“毘卢遮那佛”所说：
佛言：“秘密主！诸尊有三种身，所谓字、印、形像。彼字有二种，谓声及菩提心。印有二种，所谓有形、无形。本尊之身亦有二种，所谓清净、非清净。彼证净身离一切相，非净有想之身，则有显形众色。彼二种尊形，成就二种事：有想故，成就有相悉地，无想故，随生无相悉地。”而说偈言：“佛说有想故，乐欲成有相；以住无想故，获无相悉地；是故一切种，当住于非想。”[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说本尊三昧品第28〉，《大正藏》册18，页44，上16-25。]
《大日经》的“毘卢遮那佛”认为“入我、我入”、起“佛慢”以后，仍然缘本尊有形像的缘故，还是有想、有分别的，那不是究竟的清净，因此行者必须再详细观察，去观察那个能观察本尊的心无形无相，是无想、无分别，那才是究竟清净，所以密教行者应该安住于此一念不生而了了常知的无想、无分别当中，并将之延长，而且延长的时间越久越好。因为这样的缘故，有一位密教行者对纯粹意识境界的无相、无想悉地的内涵描述非常好：
要知道，任何破坏本元心的东西都不是好东西，甚至包括你见到的本尊。所以说，佛来也杀，魔来也杀，见到本尊的时候也不要执著相。你如果执著本尊的话仍然流于了二元对立。因为在真心状态下你和本尊是无二无别的，你契入的明空和本尊证得的那个明空是同一种明空。因此，你和本尊无二无别，你这滴水流进了佛菩萨的智慧大海，你们是无二无别的一定要明白这个道理。[雪漠著，《光明大手印：实修心髓》下卷，中央编译出版社（北京市），2012.4初版2刷，页84。]
这位密教行者已经很清楚告知：要将能观的心处于无相、无想、无分别的明空状态中，这样就是证得《大日经》的“毘卢遮那佛”所说的无相、无想悉地。此外，《大日经》的“毘卢遮那佛”在同卷再次强调，实证“有相、有想”与“无相、无想”的人，就是证得清净与不清净差别之所在，前二者是不清净境界，后二者是清净境界（编案：其实仍然是不清净的意识境界，妄谓是清净的真心境界）如下：
愚童凡夫于自性空形像自我分生颠倒不实，起诸分别，或复供养，或加毁害。秘密主！当如是住修身念，观察性空。复次，秘密主！心无自性，离一切想故，当思惟性空。秘密主！心于三时求不可得，以过三世故，如是自性远离诸相。秘密主！有心想者，即是愚童凡夫之所分别，由不了知，有如是等虚妄横计。如彼不实不生，当如是思念。秘密主！此真言门修菩萨行诸菩萨证得无相三昧，由住无相三昧故，如来所说真语，亲对其人常现在前。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说无相三昧品第29〉，《大正藏》册18，页44，中8-18。]
然而《大日经》的“毘卢遮那佛”以及密教行者所说的本尊瑜伽，有下列六种过失存在：第一种，本尊瑜伽本身是粗浅的修定法门，与修慧法门无关。第二种，观想出来的本尊，也就是密教所谓的菩提心，它有形有相，不是如释迦世尊所说的菩提心无形无相。第三种，密教行者所亲“证”的菩提心是能观的意识心，而且还要把能观的意识心处于一念不生、离念灵知的状态中，根本不是释迦世尊所开示“一切有情从本以来离种种觉观境界的真心”。第四种，密教行者于观想本尊佛成就时，即认为自己已具有诸佛三十二大人相、八十随形好的功德，其实仍然是凡夫，连一相、一好的功德也没有。第五种，佛没有慢，是密教行者心中有慢。第六种，决定密教行者根器的人没有为人悉檀的善巧方便。分别说明如下：
第一种，本尊瑜伽本身是粗浅的修定法门，与修慧法门无关。前已说，本尊瑜伽本是心月轮的一部分，但是比心月轮复杂，心月轮本身又是与修定法门有关，本尊瑜伽当然脱离不了修定的范畴。如果密教行者如实去修本尊瑜伽，所修得的定，大不了是欲界定而已，还是无法发起色界定的初禅。为什么？因为密教行者主张以男女交合的性力行门来证解脱，其所说的法，不离男女双身邪淫法，那是欲界最重贪，尚且在欲界境界中，心性还没有出离欲界，怎么有可能发起色界定的初禅，乃至证得初禅以上的定力呢？在佛门中，三乘贤圣初禅的发起，是要先有未到地定的功夫，并且经由观行断三缚结而成为初果人，以及努力地将性障加以消除而成为薄贪瞋痴的二果人以后，再进而将欲界的欲贪等五盖断除，尤其是对男女欲的欲贪断除，才有可能发起初禅而成为三果人，所以在“阿含解脱道中，有证得初禅的凡夫，没有不证初禅的三果人，也没有不证初禅的慧解脱阿罗汉”。[平实导师著，《阿含正义–唯识学探源》第四辑，正智出版社（台北市），2007.2初版首刷，页1206。]如果没有证得初果及二果的功德、没有证得未到地定的功夫、没有对性障加以消除等等，想要发起初禅而正性离生那是不可能的事（编案：凡夫经由修定降伏五盖虽亦可证得初禅，但异生性未断故，无法永离欲界生）。既然密教行者尚且未断三缚结成初果人，而且修本尊瑜伽最多只能获得欲界定而已，五盖未断未伏当然不可能证得初禅，更不可能证得初禅以上的定力。此外，密教还将男女双身邪淫法纳入修行的体系内，更是落在释迦世尊在《楞严经》卷10所开示的五现涅槃[《大佛顶如来密因修证了义诸菩萨万行首楞严经》卷10：“又三摩中诸善男子，坚凝正心，魔不得便；穷生类本，观彼幽清常扰动元，于后后有生计度者，是人坠入五涅槃论：或以欲界为正转依，观见圆明，生爱慕故；或以初禅性无忧故，或以二禅心无苦故，或以三禅极悦随故，或以四禅苦乐二亡，不受轮回生灭性故；迷有漏天，作无为解：‘五处安隐，为胜净依。’如是循环五处究竟，由此计度五现涅槃，堕落外道，惑菩提性；是则名为第十外道立五阴中五现涅槃，心颠倒论。”《大正藏》册19，页153，上15-24。]当中，是“以欲界为正转依，观见圆明，心生爱慕”的第一种外道涅槃，更不可能发起初禅。由此可知：密教行者错把修定法门的本尊瑜伽，当作是修慧法门，已经严重偏离佛门二主要道，与之渐行渐远了。
第二种，观想出来的本尊，也就是密教所谓的菩提心，它有形有相，不是如释迦世尊所开示的菩提心无形无相，正如文殊菩萨在《文殊师利所说摩诃般若波罗蜜经》卷上开示：
尔时舍利弗白佛言：“世尊！如文殊师利所说般若波罗蜜，非初学菩萨所能了知。”文殊师利言：“非但初学菩萨所不能知，及诸二乘所作已办者亦未能了知。如是说法，无能知者。何以故？菩提之相，实无有法而可知故，无见无闻、无得无念、无生无灭、无说无听。如是菩提性相空寂、无证无知、无形无相，云何当有得菩提者？”[《文殊师利所说摩诃般若波罗蜜经》卷上，《大正藏》册8，页728，中1-8。]
文殊菩萨已经很清楚开示：菩提真心本身无生无灭、无形无相，怎么会是《大日经》的“毘卢遮那佛”以及密教行者所说的菩提心有生有灭、有形有相呢？纵使密教行者观想出来佛菩萨本尊，甚至认为那就是佛菩萨本有的菩提心，但实际上，那是密教行者自己观想所成的内相分，它是有形有相、有生有灭的意识境界，不是释迦世尊、文殊菩萨所开示无形无相、无生无灭的菩提心。由于密教行者被《大日经》的“毘卢遮那佛”错误灌输菩提心有形有相，因此心里作意，意识如实去观想，最后所观想的佛菩萨本尊形相出现，也是密教行者所认为佛菩萨本有的菩提心出现时，错认那是一切有情的菩提心，其实仅是自己观想所成的内相分，与真实无生无灭、无形无相的菩提心一点关系也没有。譬如你观想烧了一百万元供养你的上师，一问：你真的烧了一百万元供养上师吗？显然没有嘛！因为那是你自己观想出来，而说已经烧了一百万元来供养上师。二问：你的上师真的有收到你所烧的一百万元吗？显然没有嘛！因为那是行者自己观想所成的内相分，上师根本不知道、也看不见，更收不到这一百万元，不是吗？三问：若观想自己是佛时，当时是佛，没有观想时，自己变成凡夫而不再是佛了，像这样在凡夫与佛之间变来变去的法，还是真实法吗？四问：当在睡著无梦等五无心位时，意识已经不现行了，已经无法进行观想，这时佛在何处？还会是佛吗？由此可以证明：密教行者所观想出来的本尊，是密教行者自己的内相分，它是本无今有之法，是虚妄法，不是真实法，更何况将观想所成的虚妄法当作是真实法，不是妄上加妄，更是虚妄吗？所以说，密教行者将观想当真，乃是错误、不正确的说法。由于此错，导致密教后来的修行方向统统错误而走偏了。譬如在无上瑜伽密教里，他们会观想菩提心就是红菩提、白菩提，并透过拙火瑜伽观想红菩提从脐轮出现，乃至上升到顶轮，产生四空，也就是空、胜空、超空、俱生空，并与白菩提融合为一，因而下降，产生四喜，也就是初喜、胜喜、超喜、俱生喜出现，乃至于观想自己与本尊菩提心融合，往生本尊的净土去了。像这样的观想，一者，乃是在虚妄法当中把它当作真实法，其所得的结果，仍然是虚妄啊！二者，释迦世尊说有情自身的菩提心仅有一个，祂无形无相、本来无生，绝不会如密教行者所说菩提心有二个：红菩提、白菩提，它有生有灭、有形有相，而且还分别在脐轮与顶轮中，乃至观想红白菩提在顶轮融入而合并为一个等等。像密教行者这样被人严重误导、蒙骗而盲修瞎练，导致自己穷尽一生努力精进修行的结果，仍然是一无所获，真的很悲哀啊！
第三种，密教行者所证的菩提心不离能观的意识心，是要把能观的意识心处于一念不生而离念灵知的状态中，于六尘了了分明，根本不是释迦世尊所开示“一切有情从本以来离种种觉观境界的真心”。密教所谓的菩提心，就是将能观的意识心处于一念不生的状态，也就是佛教所说的离念灵知心，祂生灭无常不是一切有情真心。譬如在打坐的时候，进入非常清楚湛然的状态中，忽然听到家人喊你，你不起语言文字，仍可以很清楚知道家人正在叫你，而且还很清楚知道家人叫你的内容是什么。这样的离念灵知心，能于种种境不起语言文字而清楚了别，密教行者希望长时保持这样的离念灵知的状态而不灭，正如《大日经》的“毘卢遮那佛”在卷3开示：
于园苑僧坊，若在岩窟中，或意所乐处，观彼菩提心，乃至初安住，不生疑虑意。随取彼一心，以心置于心，证于极净句，无垢安不动，不分别如镜，现前甚微细。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷3〈悉地出现品第6〉，《大正藏》册18，页18，下1-6。]
一者，《大日经》的“毘卢遮那佛”就是要行者保持能观的觉知心处于一念不生的状态，妄谓“证得此境界，就是证得如如不动的真心境界”。二者，密教行者认为以观想的本尊为菩提心，方可进而化为光明融入所观想的本尊中，才能成就《大日经》的“毘卢遮那佛”所说“以心置于心”而一念不生。然而如是观想，不离能观与所观相对待境界故，能观的意识心仍然未融入所观想的本尊相分中，能观的意识心之见分仍旧外于本尊形像之相分独立存在而对相分广了别，本尊形像之相分仍然存在密教行者意识所观想的境界中，仍然是意识能取的见分与意识所取的相分两个相对待法各自在运作，而不是融入成为一个法，不是吗？如果真的如密教行者所说是融入成为一个，唯识学见相二分说就要被密教行者改写了，可是现见他们不能，也没有办法改写这样的事实，不是吗？而不仅《大日经》的“毘卢遮那佛”这样认为，连《大日经》翻译者善无畏，在他的《无畏三藏禅要》也如是认为：
行者久久作此观，观习成就不须延促，唯见明朗更无一物，亦不见身之与心，万法不可得，犹如虚空，亦莫作空解，以无念等故，说如虚空非谓空想。久久能熟，行住坐卧一切时处，作意与不作意，任运相应无所罣碍，一切妄想、贪瞋痴等一切烦恼，不假断除，自然不起。性常清净，依此修习，乃至成佛，唯是一道更无别理。[《无畏三藏禅要》，《大正藏》册18，页945，中21-28。]
善无畏表示：凡是修学本尊瑜伽的密教行者，要将能观的意识心长时保持清清楚楚、明明白白更无一物状态中，不再有其他妄想、妄念出现，妄谓证此离念灵知的状态，就是已融入本尊瑜伽中，就是证得一切有情的菩提心，乃至成佛。然而这样离念灵知的境界，不离能所与觉观的相对待境界，不是真心离能所、离觉观、离见闻觉知的绝对待境界。又譬如这个离念灵知心，于睡著无梦时，意识断了，不再离念灵知，须待隔天天亮醒来以后，离念灵知心才能再度现起，所以祂是有生有灭的法，不是本有的法。既然不是本有的法，表示祂不是一切有情真心，是为妄心所摄。由此可以证明：修本尊瑜伽只是与生灭不已的意识心相应，不是与从本以来离能所、离觉观的真心相应。（待续）
尔时执金刚秘密主白佛言：“世尊！愿说诸尊色像威验现前，令真言门修菩萨行诸菩萨观缘本尊形故，即本尊身以为自身，无有疑惑而得悉地。”如是说已，佛告执金刚秘密主言：“善哉！善哉！秘密主！汝能问吾如是义，善哉！谛听极善作意，吾今演说。”[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说本尊三昧品第28〉，《大正藏》册18，页44，上10-15。]
又譬如“毘卢遮那佛”与秘密主另一处对话如下：
若依法教，于真言门修菩萨行诸菩萨应如是知：自身住本尊形，坚固不动；知本尊已，如本尊住，而得悉地。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷5〈秘密八印品第14〉，《大正藏》册18，页37，上2-4。]
由“毘卢遮那佛”与秘密主对话可知，《大日经》已谈到本尊瑜伽，也就是要观想某一尊佛菩萨本尊出现、观想佛菩萨本尊入行者身，行者观想自己也进入佛菩萨本尊身中而安住，也就是密教行者所说的入我、我入，而且还要坚固地认为自己就是佛菩萨本尊，《大日经》的“毘卢遮那佛”宣称这样可以成就所说的种种悉地，乃至成佛。由此缘故，有二人如是描述本尊瑜伽的真实内涵，如第一位学者描述：
密宗本尊法，又名本尊瑜伽，为密宗的重要大法，体现了密宗变身的原理，随著越来越多的佛菩萨登上密坛，涉及的范围甚为广泛，为密宗行者生起次第所必修。
本尊法，即是密宗行者在诸佛菩萨中，选定一位与你有缘的佛尊作为本体佛，观想自身变成本体佛的修法。《大日经》云：一身与二身，乃至无量身，同入本体。本尊法的修持，即根据此原理。用通俗的话说，即是：你就是本尊，本尊就是你。例如，你若修阿弥陀佛为本尊，你就观想自己为阿弥陀佛；你若修观世音菩萨为本尊，你就观想自己为观世音菩萨，等等。密宗行者可始终如一专修一尊本尊，这是一心与本尊融合，才能变成本尊的缘故。这种变身的原理，主要在于密宗行者的身、口、意三密，成为本尊的身、口、意三密，密宗行者完全与本尊相应。《密教通关》一书说：诸佛三密与行者三密，共遍法界，平等平等，故诸佛真言印契，与行者真言印契，亦平等无二。以印明皆等，故能引诸佛入吾身也，诸佛既入我身，故其功德亦为我有。[邱陵编著，《密宗入门知识》，北京工业大学出版社（北京市），1993.1初版1刷，页70。]
另一位密教行者描述本尊瑜伽内涵如下：
故密宗行者之所观本尊，多为佛和菩萨。诸佛菩萨传了诸多法门，有诸多心咒，你修哪位佛菩萨，观其形神，诵其密咒，发其心愿，哪位佛菩萨便是你的本尊。修本尊法时，行者便有了一个灵魂标杆，除将凡俗色身观为智慧佛身外，其身口意，不离慈悲，不离真言，所闻无非咒声，所见无非本尊坛城，所做皆是利众之事，久久熏习，人格定然升华，终而与本尊无二无别。[雪漠著，《光明大手印：实修心髓》上卷，中央编译出版社（北京市），2012.4初版2刷，页172-173。]
所谓密教的本尊瑜伽，就是密教行者选定一位佛菩萨，这位佛菩萨本身具备了字、印、形像[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说本尊三昧品第28〉：“佛言：‘秘密主！诸尊有三种身，所谓字、印、形像。’”《大正藏》册18，页44，上16-17，其中字为种子字，印为佛菩萨手印、所持的器物等，形像为本尊的法相。]，作为密教行者所观想的对象，然后将其观想清楚后，本尊的佛菩萨（编案：其实是行者自己观想所现的内相分）就会出现在行者前，这时行者要“入我、我入”及明显地、坚决地生起“佛慢”，这时候“你就是本尊、你就是佛”[尕藏加著，《密宗—藏传佛教神秘文化》，中国藏学出版社（北京市），2007.1初版1刷，页132-133。]—自己与本尊、自己与佛菩萨无二无别；所以密教行者非常注重本尊瑜伽的修练，认为可以使自己快速成佛，这也是学者所说，本尊瑜伽观想修定法门，乃是假藏传佛教重要特色之一之所在。
由于各派所说的本尊瑜伽方法各不相同，乃至同一派各个上师所说的内容也不尽相同，但不外四个大方向：一、观想本尊或本尊与佛母双运，显现在行者对面的空中，并化作一道光芒，罩住行者，使行者心安住不动。二、观想本尊或本尊与佛母双运移到行者头上，放出光芒，流出甘露水（男女交合所产生男精女血的淫液），充满行者自身，消除行者一切业障而得大自在。三、观想本尊或本尊与佛母双运缩小，成为一个小光点（编案：这也是密教行者修心月轮的收敛观之所在），从行者顶门，直入行者月轮莲花座上。四、观想光点之本尊或本尊与佛母双运变大，与自身一样大，完全与本尊或本尊与佛母双运合一，行者一切的成就，与本尊成就无二无别。其详细步骤说明如下：
第一步骤：选本尊。由于藏密各派所观的本尊各不相同，譬如有人用莲花生为本尊，有人用大威德金刚为本尊，有人用密集金刚为本尊，乃至有人用佛菩萨与佛母双运为本尊等等，为避免产生困扰，统一用本尊一词来说明。密教选本尊的方法有下列四种方法：第一种方法，散花得佛；第二种方法，干支得佛；第三种方法，根据行者自己意愿和心性选择本尊；第四种方法，上师根据徒弟的特性、习性、素质和了解，为徒弟选择本尊。如一位学者所说：
密宗行者选择自己本尊的方法有多种，首先有散花得佛之法，即利用散花来寻找本体佛。行者面向曼荼罗（即坛城，罗列诸佛菩萨像的密坛），两眼紧闭，或用布巾包住眼睛，然后手拿花朵，心中虔诚念祷，把花朵抛向曼荼罗，花朵落在哪一位佛尊之上，就表示哪位佛尊与你有缘，可以成为你的本尊。
使用散花得佛的方法，必须先有曼荼罗，如果没有曼荼罗的设备，密宗于是用干支得佛之法。散花得佛选出的本尊，是后天的本体佛，干支得佛是与生俱来的先天的本体佛。干支得佛之法，就是依照行者的生年干支，去决定自身的本尊。
各生年的干支本尊如下：鼠年：千手观音菩萨，牛年：虚空藏菩萨，虎年：虚空藏菩萨，兔年：文殊菩萨，龙年：普贤菩萨，蛇年：普贤菩萨，马年：大势至菩萨，羊年：大日如来，猴年：大日如来，鸡年：不动明王，狗年：阿弥陀佛，猪年：阿弥陀佛。
除了生年的本尊外，也有出生月份的本尊，前者为主，后者为副。农历出生月份的本尊如下：元月：虚空藏菩萨，二月：文殊菩萨，三月：普贤菩萨，四月：普贤菩萨，五月：大势至菩萨，六月：大日如来，七月：大日如来，八月：不动明王，九月：阿弥陀佛，十月：阿弥陀佛，十一月：千手观音菩萨，十二月：虚空藏菩萨。
除上述方法外，也有利用缘日来选本尊的。缘日就是有缘之日，即是看你在农历哪一天出生，就代表该缘日的佛菩萨与你有缘，会终生伴著你。
缘日和缘日本尊对照如下：一日：定光佛，二日：燃灯佛，三日：多宝佛，四日：阿閦佛，五日：弥勒菩萨，六日：二万灯佛，七日：三万灯佛，八日：药师如来，九日：大通智胜佛，十日：日月灯明佛，十一日：欢喜佛，十二日：难胜如来，十三日：虚空藏菩萨，十四日：普贤菩萨，十五日：阿弥陀佛，十六日：陀罗尼菩萨，十七日：龙树菩萨，十八日：观世音菩萨，十九日：日光菩萨，二十日：月光菩萨，二十一日：无尽意菩萨，二十二日：施无畏菩萨，二十三日：大势至菩萨，二十四日：地藏菩萨，二十五日：文殊师利菩萨，二十六日：药王菩萨，二十七日：毗庐遮那如来，二十八日：大日如来，二十九日：药王菩萨，三十日：释迦如来。
除了上述方法，密宗行者也可以根据自己的意愿和心性选择本尊。行者认为哪一尊佛菩萨与自己最投缘，最有缘份，就自行选择为自己的本尊。这样也许更有意义。
当然也可由上师根据徒弟的特性、习性、素质和了解，为徒弟选择本尊。有的红教法派规定男弟子一律以莲华生大士为本尊，女弟子一律以绿度母为本尊，这也未尝不可。[邱陵编著，《密宗入门知识》，北京工业大学出版社（北京市），1993.1初版1刷，页71-74。]
第二步骤：修练本尊的方法，有对生本尊、自生本尊、顶生本尊、肩生本尊。所谓的对生本尊，就是于行者四尺前挂本尊佛菩萨图像，以作为行者观想之用。所谓的自生本尊，是心中直观本尊佛菩萨相。所谓的顶生本尊，是修百字明[百字明，乃是密教行者所创造的咒语，根本不是佛菩萨所说的咒语，其本质与男女双运邪淫法有关，其所忏悔的对象是鬼神，而不是佛菩萨，故密教行者欲忏悔灭罪而唱诵的百字明，其忏悔根本无效，欲知详情，请参阅平实导师著，《狂密与真密》第四辑，正智出版社（台北市），2002.8初版1刷，页1195-1198。除此之外，密教行者还创造百字明手印如下：“两手内内相叉，二大指〔空轮〕、食指〔风轮〕、并伸直。”慧律法师讲授，释法印整理，《安乐妙宝仪轨》（一），倡印者：财团法人文殊文教基金会，流通者：高雄文殊讲堂，2004.5新版1刷，页72。]或迁识瑜伽（于第三章第七节介绍）等法时，观想在自己顶上约一箭的高度，有一尺高的本尊佛菩萨相，与自己同一方向。所谓的肩生本尊，就是行走时，观想本尊佛菩萨立于右肩。一般而言，选对生本尊、自生本尊及顶生本尊比较多，因此本节仅介绍这三种。刚开始修练的时候，对于本尊瑜伽观想无法掌握重点，可先练习对生本尊的图像观想，于此练习纯熟了，直接进行自生本尊的观法。（编案：这是根据密教法作说明，非是鼓励读者修学。）但不论是对生本尊或自生本尊，都是缘同一个本尊进行观想，如善无畏在《大日经》卷7说明：
行者应生决定意，先当一缘观本尊，持彼真言秘密印，自作瑜伽本尊像，如其色相威仪等，我身无二行亦同，由住本地相应身，虽少福者亦成就。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷7〈持诵法则品第4〉，《大正藏》册18，页51，中14-17。]
第三步骤：进行三密修行，即念本尊咒语、结本尊印及观想本尊。观想本尊有六个小步骤如下：
第一点：观想本尊现身在行者正对面空中，发出一道光笼罩行者而安住不动。
第二点：观想本尊移到行者头上放光明（编案：即顶生本尊），以及本尊流出甘露水灌行者顶，甘露水遍满行者全身而消除一切业障，身中黑气从全身毛孔排出（编案：这是密教行者观想所成的内相分，也是密教行者的的虚妄想，妄想业障化成黑气从全身毛孔排出）。
第三点：观想头顶上的本尊缩小成一个小点，从行者顶上直入月轮莲花座上，此时本尊化成一拇指大，就在行者心中的莲花座上。至于观想本尊缩小成一个小点，是无上瑜伽密教行者心月轮之收敛观、红菩提从脐轮出现、红白菩提在顶轮融合为一，乃至与那洛六法有关的前方便。
第四点：观想本尊渐渐变大，与行者身体一样大，并与自己身体合一，而且还要清清楚楚、明明白白，如《大日经》卷7善无畏所说：
住于本尊位，正觉当现前，乃至谛明了，应当如是见。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷7〈持诵法则品第4〉，《大正藏》册18，页51，下28-29。]
第五点：入我、我入，起“佛慢”。行者于此清清楚楚、明明白白的状态中，要进行“入我、我入”，起“佛慢”，即本尊入我身（入我）、我入本尊（我入），这时，不再起自己是凡夫众生的下劣想，自身已变成佛菩萨本尊，自己也继承佛菩萨本尊的种种功德，如《大日经》卷6的“毘卢遮那佛”所说：
是故诸本尊即我，我即本尊，互相发起，身所生身，尊形像生。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈百字位成品第21〉，《大正藏》册18，页41，上13-14。]
不仅如此，善无畏也主张“观想本尊瑜伽成就后，自己就是佛了”：
如前住瑜伽，加持亦如是，智者观自体，等同如来身。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷7〈持诵法则品第4〉，《大正藏》册18，页52，下8-10。]
像这样不再起凡夫众生下劣想，而且明显地、坚决地认为自己就是佛，而以佛自居，就是密教行者所说的“佛慢”，而且是“佛慢坚固”，正如一位密教行者所说：
生起次第最主要的目的就是，首先破除“我是凡夫”这种观念。这个见地非常重要。无上瑜伽的真正精髓正是这一点，它直接告诉你：你是佛，不是凡夫；你是本尊，本尊就是你。[雪漠著，《光明大手印：实修心髓》下卷，中央编译出版社（北京市），2012.4初版2刷，页78。]
第六点：缘有相、无相、有想、无想，以此来分清净与否之差别。行者进行“入我、我入”、起“佛慢”以后，以一念不生而了了常知的状态安住，这时，缘本尊有形有相故，是有想、有分别，表示行者的心不清净；如果行者观察这个能观察本尊的意识心无形无相，是无想、无分别（编案：其实仍然有分别，妄谓没有分别），表示行者的心是清净的，如《大日经》卷6的“毘卢遮那佛”所说：
佛言：“秘密主！诸尊有三种身，所谓字、印、形像。彼字有二种，谓声及菩提心。印有二种，所谓有形、无形。本尊之身亦有二种，所谓清净、非清净。彼证净身离一切相，非净有想之身，则有显形众色。彼二种尊形，成就二种事：有想故，成就有相悉地，无想故，随生无相悉地。”而说偈言：“佛说有想故，乐欲成有相；以住无想故，获无相悉地；是故一切种，当住于非想。”[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说本尊三昧品第28〉，《大正藏》册18，页44，上16-25。]
《大日经》的“毘卢遮那佛”认为“入我、我入”、起“佛慢”以后，仍然缘本尊有形像的缘故，还是有想、有分别的，那不是究竟的清净，因此行者必须再详细观察，去观察那个能观察本尊的心无形无相，是无想、无分别，那才是究竟清净，所以密教行者应该安住于此一念不生而了了常知的无想、无分别当中，并将之延长，而且延长的时间越久越好。因为这样的缘故，有一位密教行者对纯粹意识境界的无相、无想悉地的内涵描述非常好：
要知道，任何破坏本元心的东西都不是好东西，甚至包括你见到的本尊。所以说，佛来也杀，魔来也杀，见到本尊的时候也不要执著相。你如果执著本尊的话仍然流于了二元对立。因为在真心状态下你和本尊是无二无别的，你契入的明空和本尊证得的那个明空是同一种明空。因此，你和本尊无二无别，你这滴水流进了佛菩萨的智慧大海，你们是无二无别的一定要明白这个道理。[雪漠著，《光明大手印：实修心髓》下卷，中央编译出版社（北京市），2012.4初版2刷，页84。]
这位密教行者已经很清楚告知：要将能观的心处于无相、无想、无分别的明空状态中，这样就是证得《大日经》的“毘卢遮那佛”所说的无相、无想悉地。此外，《大日经》的“毘卢遮那佛”在同卷再次强调，实证“有相、有想”与“无相、无想”的人，就是证得清净与不清净差别之所在，前二者是不清净境界，后二者是清净境界（编案：其实仍然是不清净的意识境界，妄谓是清净的真心境界）如下：
愚童凡夫于自性空形像自我分生颠倒不实，起诸分别，或复供养，或加毁害。秘密主！当如是住修身念，观察性空。复次，秘密主！心无自性，离一切想故，当思惟性空。秘密主！心于三时求不可得，以过三世故，如是自性远离诸相。秘密主！有心想者，即是愚童凡夫之所分别，由不了知，有如是等虚妄横计。如彼不实不生，当如是思念。秘密主！此真言门修菩萨行诸菩萨证得无相三昧，由住无相三昧故，如来所说真语，亲对其人常现在前。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷6〈说无相三昧品第29〉，《大正藏》册18，页44，中8-18。]
然而《大日经》的“毘卢遮那佛”以及密教行者所说的本尊瑜伽，有下列六种过失存在：第一种，本尊瑜伽本身是粗浅的修定法门，与修慧法门无关。第二种，观想出来的本尊，也就是密教所谓的菩提心，它有形有相，不是如释迦世尊所说的菩提心无形无相。第三种，密教行者所亲“证”的菩提心是能观的意识心，而且还要把能观的意识心处于一念不生、离念灵知的状态中，根本不是释迦世尊所开示“一切有情从本以来离种种觉观境界的真心”。第四种，密教行者于观想本尊佛成就时，即认为自己已具有诸佛三十二大人相、八十随形好的功德，其实仍然是凡夫，连一相、一好的功德也没有。第五种，佛没有慢，是密教行者心中有慢。第六种，决定密教行者根器的人没有为人悉檀的善巧方便。分别说明如下：
第一种，本尊瑜伽本身是粗浅的修定法门，与修慧法门无关。前已说，本尊瑜伽本是心月轮的一部分，但是比心月轮复杂，心月轮本身又是与修定法门有关，本尊瑜伽当然脱离不了修定的范畴。如果密教行者如实去修本尊瑜伽，所修得的定，大不了是欲界定而已，还是无法发起色界定的初禅。为什么？因为密教行者主张以男女交合的性力行门来证解脱，其所说的法，不离男女双身邪淫法，那是欲界最重贪，尚且在欲界境界中，心性还没有出离欲界，怎么有可能发起色界定的初禅，乃至证得初禅以上的定力呢？在佛门中，三乘贤圣初禅的发起，是要先有未到地定的功夫，并且经由观行断三缚结而成为初果人，以及努力地将性障加以消除而成为薄贪瞋痴的二果人以后，再进而将欲界的欲贪等五盖断除，尤其是对男女欲的欲贪断除，才有可能发起初禅而成为三果人，所以在“阿含解脱道中，有证得初禅的凡夫，没有不证初禅的三果人，也没有不证初禅的慧解脱阿罗汉”。[平实导师著，《阿含正义–唯识学探源》第四辑，正智出版社（台北市），2007.2初版首刷，页1206。]如果没有证得初果及二果的功德、没有证得未到地定的功夫、没有对性障加以消除等等，想要发起初禅而正性离生那是不可能的事（编案：凡夫经由修定降伏五盖虽亦可证得初禅，但异生性未断故，无法永离欲界生）。既然密教行者尚且未断三缚结成初果人，而且修本尊瑜伽最多只能获得欲界定而已，五盖未断未伏当然不可能证得初禅，更不可能证得初禅以上的定力。此外，密教还将男女双身邪淫法纳入修行的体系内，更是落在释迦世尊在《楞严经》卷10所开示的五现涅槃[《大佛顶如来密因修证了义诸菩萨万行首楞严经》卷10：“又三摩中诸善男子，坚凝正心，魔不得便；穷生类本，观彼幽清常扰动元，于后后有生计度者，是人坠入五涅槃论：或以欲界为正转依，观见圆明，生爱慕故；或以初禅性无忧故，或以二禅心无苦故，或以三禅极悦随故，或以四禅苦乐二亡，不受轮回生灭性故；迷有漏天，作无为解：‘五处安隐，为胜净依。’如是循环五处究竟，由此计度五现涅槃，堕落外道，惑菩提性；是则名为第十外道立五阴中五现涅槃，心颠倒论。”《大正藏》册19，页153，上15-24。]当中，是“以欲界为正转依，观见圆明，心生爱慕”的第一种外道涅槃，更不可能发起初禅。由此可知：密教行者错把修定法门的本尊瑜伽，当作是修慧法门，已经严重偏离佛门二主要道，与之渐行渐远了。
第二种，观想出来的本尊，也就是密教所谓的菩提心，它有形有相，不是如释迦世尊所开示的菩提心无形无相，正如文殊菩萨在《文殊师利所说摩诃般若波罗蜜经》卷上开示：
尔时舍利弗白佛言：“世尊！如文殊师利所说般若波罗蜜，非初学菩萨所能了知。”文殊师利言：“非但初学菩萨所不能知，及诸二乘所作已办者亦未能了知。如是说法，无能知者。何以故？菩提之相，实无有法而可知故，无见无闻、无得无念、无生无灭、无说无听。如是菩提性相空寂、无证无知、无形无相，云何当有得菩提者？”[《文殊师利所说摩诃般若波罗蜜经》卷上，《大正藏》册8，页728，中1-8。]
文殊菩萨已经很清楚开示：菩提真心本身无生无灭、无形无相，怎么会是《大日经》的“毘卢遮那佛”以及密教行者所说的菩提心有生有灭、有形有相呢？纵使密教行者观想出来佛菩萨本尊，甚至认为那就是佛菩萨本有的菩提心，但实际上，那是密教行者自己观想所成的内相分，它是有形有相、有生有灭的意识境界，不是释迦世尊、文殊菩萨所开示无形无相、无生无灭的菩提心。由于密教行者被《大日经》的“毘卢遮那佛”错误灌输菩提心有形有相，因此心里作意，意识如实去观想，最后所观想的佛菩萨本尊形相出现，也是密教行者所认为佛菩萨本有的菩提心出现时，错认那是一切有情的菩提心，其实仅是自己观想所成的内相分，与真实无生无灭、无形无相的菩提心一点关系也没有。譬如你观想烧了一百万元供养你的上师，一问：你真的烧了一百万元供养上师吗？显然没有嘛！因为那是你自己观想出来，而说已经烧了一百万元来供养上师。二问：你的上师真的有收到你所烧的一百万元吗？显然没有嘛！因为那是行者自己观想所成的内相分，上师根本不知道、也看不见，更收不到这一百万元，不是吗？三问：若观想自己是佛时，当时是佛，没有观想时，自己变成凡夫而不再是佛了，像这样在凡夫与佛之间变来变去的法，还是真实法吗？四问：当在睡著无梦等五无心位时，意识已经不现行了，已经无法进行观想，这时佛在何处？还会是佛吗？由此可以证明：密教行者所观想出来的本尊，是密教行者自己的内相分，它是本无今有之法，是虚妄法，不是真实法，更何况将观想所成的虚妄法当作是真实法，不是妄上加妄，更是虚妄吗？所以说，密教行者将观想当真，乃是错误、不正确的说法。由于此错，导致密教后来的修行方向统统错误而走偏了。譬如在无上瑜伽密教里，他们会观想菩提心就是红菩提、白菩提，并透过拙火瑜伽观想红菩提从脐轮出现，乃至上升到顶轮，产生四空，也就是空、胜空、超空、俱生空，并与白菩提融合为一，因而下降，产生四喜，也就是初喜、胜喜、超喜、俱生喜出现，乃至于观想自己与本尊菩提心融合，往生本尊的净土去了。像这样的观想，一者，乃是在虚妄法当中把它当作真实法，其所得的结果，仍然是虚妄啊！二者，释迦世尊说有情自身的菩提心仅有一个，祂无形无相、本来无生，绝不会如密教行者所说菩提心有二个：红菩提、白菩提，它有生有灭、有形有相，而且还分别在脐轮与顶轮中，乃至观想红白菩提在顶轮融入而合并为一个等等。像密教行者这样被人严重误导、蒙骗而盲修瞎练，导致自己穷尽一生努力精进修行的结果，仍然是一无所获，真的很悲哀啊！
第三种，密教行者所证的菩提心不离能观的意识心，是要把能观的意识心处于一念不生而离念灵知的状态中，于六尘了了分明，根本不是释迦世尊所开示“一切有情从本以来离种种觉观境界的真心”。密教所谓的菩提心，就是将能观的意识心处于一念不生的状态，也就是佛教所说的离念灵知心，祂生灭无常不是一切有情真心。譬如在打坐的时候，进入非常清楚湛然的状态中，忽然听到家人喊你，你不起语言文字，仍可以很清楚知道家人正在叫你，而且还很清楚知道家人叫你的内容是什么。这样的离念灵知心，能于种种境不起语言文字而清楚了别，密教行者希望长时保持这样的离念灵知的状态而不灭，正如《大日经》的“毘卢遮那佛”在卷3开示：
于园苑僧坊，若在岩窟中，或意所乐处，观彼菩提心，乃至初安住，不生疑虑意。随取彼一心，以心置于心，证于极净句，无垢安不动，不分别如镜，现前甚微细。[《大毘卢遮那成佛神变加持经》卷3〈悉地出现品第6〉，《大正藏》册18，页18，下1-6。]
一者，《大日经》的“毘卢遮那佛”就是要行者保持能观的觉知心处于一念不生的状态，妄谓“证得此境界，就是证得如如不动的真心境界”。二者，密教行者认为以观想的本尊为菩提心，方可进而化为光明融入所观想的本尊中，才能成就《大日经》的“毘卢遮那佛”所说“以心置于心”而一念不生。然而如是观想，不离能观与所观相对待境界故，能观的意识心仍然未融入所观想的本尊相分中，能观的意识心之见分仍旧外于本尊形像之相分独立存在而对相分广了别，本尊形像之相分仍然存在密教行者意识所观想的境界中，仍然是意识能取的见分与意识所取的相分两个相对待法各自在运作，而不是融入成为一个法，不是吗？如果真的如密教行者所说是融入成为一个，唯识学见相二分说就要被密教行者改写了，可是现见他们不能，也没有办法改写这样的事实，不是吗？而不仅《大日经》的“毘卢遮那佛”这样认为，连《大日经》翻译者善无畏，在他的《无畏三藏禅要》也如是认为：
行者久久作此观，观习成就不须延促，唯见明朗更无一物，亦不见身之与心，万法不可得，犹如虚空，亦莫作空解，以无念等故，说如虚空非谓空想。久久能熟，行住坐卧一切时处，作意与不作意，任运相应无所罣碍，一切妄想、贪瞋痴等一切烦恼，不假断除，自然不起。性常清净，依此修习，乃至成佛，唯是一道更无别理。[《无畏三藏禅要》，《大正藏》册18，页945，中21-28。]
善无畏表示：凡是修学本尊瑜伽的密教行者，要将能观的意识心长时保持清清楚楚、明明白白更无一物状态中，不再有其他妄想、妄念出现，妄谓证此离念灵知的状态，就是已融入本尊瑜伽中，就是证得一切有情的菩提心，乃至成佛。然而这样离念灵知的境界，不离能所与觉观的相对待境界，不是真心离能所、离觉观、离见闻觉知的绝对待境界。又譬如这个离念灵知心，于睡著无梦时，意识断了，不再离念灵知，须待隔天天亮醒来以后，离念灵知心才能再度现起，所以祂是有生有灭的法，不是本有的法。既然不是本有的法，表示祂不是一切有情真心，是为妄心所摄。由此可以证明：修本尊瑜伽只是与生灭不已的意识心相应，不是与从本以来离能所、离觉观的真心相应。（待续）
